Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Laptm4aQ60961 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Laptm4aQ60961 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms