Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Meis1Q60954 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis1Q60954 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis1Q60954 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms