Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vdac1Q60932 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vdac1Q60932 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms