Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DbpQ60925 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DbpQ60925 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DbpQ60925 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DbpQ60925 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DbpQ60925 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DbpQ60925 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DbpQ60925 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DbpQ60925 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DbpQ60925 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DbpQ60925 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms