Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Neurod1Q60867 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Neurod1Q60867 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Neurod1Q60867 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms