Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tnfrsf8Q60846 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnfrsf8Q60846 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfrsf8Q60846 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms