Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot7Q60809 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot7Q60809 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnot7Q60809 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot7Q60809 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms