Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdkn2dQ60773 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkn2dQ60773 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms