Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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PtprnQ60673 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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PtprnQ60673 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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PtprnQ60673 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprnQ60673 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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