Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema5bQ60519 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema5bQ60519 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5bQ60519 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms