Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uimc1Q5U5Q9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uimc1Q5U5Q9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms