Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc5a6Q5U4D8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc5a6Q5U4D8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc5a6Q5U4D8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms