Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gprasp1Q5U4C1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gprasp1Q5U4C1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gprasp1Q5U4C1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gprasp1Q5U4C1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gprasp1Q5U4C1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gprasp1Q5U4C1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gprasp1Q5U4C1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gprasp1Q5U4C1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gprasp1Q5U4C1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gprasp1Q5U4C1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gprasp1Q5U4C1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gprasp1Q5U4C1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms