Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Brip1Q5SXJ3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brip1Q5SXJ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms