Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med13Q5SWW4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Med13Q5SWW4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms