Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mks1Q5SW45 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms