Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sco1Q5SUC9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sco1Q5SUC9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sco1Q5SUC9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms