Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam71bQ5STT6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam71bQ5STT6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms