Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam46cQ5SSF7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam46cQ5SSF7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam46cQ5SSF7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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