Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930512M02RikQ5SQK8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4930512M02RikQ5SQK8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms