Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps54Q5SPW0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps54Q5SPW0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps54Q5SPW0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms