Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rtp3Q5QGU6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rtp3Q5QGU6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms