Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Trim41Q5NCC3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Trim41Q5NCC3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Trim41Q5NCC3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms