Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vps41Q5KU39 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vps41Q5KU39 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms