Protein–RNA interactions for Protein: Q5IBH6

Spdye4a, Speedy protein E4A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4aQ5IBH6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spdye4aQ5IBH6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spdye4aQ5IBH6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spdye4aQ5IBH6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms