Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SynaQ5G5D5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SynaQ5G5D5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154 ms