Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ecm2Q5FW85 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ecm2Q5FW85 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ecm2Q5FW85 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms