Protein–RNA interactions for Protein: Q59IW6

Abi3bp, ABI gene family, member 3 (NESH)-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abi3bpQ59IW6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abi3bpQ59IW6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abi3bpQ59IW6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abi3bpQ59IW6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms