Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
L1td1Q587J6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1td1Q587J6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
L1td1Q587J6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms