Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opa3Q505D7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Opa3Q505D7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Opa3Q505D7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Opa3Q505D7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms