Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem171Q4KL18 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem171Q4KL18 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem171Q4KL18 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms