Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Brinp3Q499E0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Brinp3Q499E0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brinp3Q499E0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brinp3Q499E0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Brinp3Q499E0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms