Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Krt35Q497I4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt35Q497I4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms