Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx25Q3ZT31 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx25Q3ZT31 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx25Q3ZT31 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms