Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga1Q3V3R4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itga1Q3V3R4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga1Q3V3R4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms