Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ckap2Q3V1H1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms