Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4r3cQ3V0Y1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms