Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Lrrc43Q3V0L5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc43Q3V0L5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrc43Q3V0L5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrc43Q3V0L5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc43Q3V0L5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc43Q3V0L5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc43Q3V0L5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc43Q3V0L5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc43Q3V0L5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc43Q3V0L5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc43Q3V0L5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms