Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Garnl3Q3V0G7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms