Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hipk4Q3V016 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hipk4Q3V016 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.8 ms