Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc55Q3UY51 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc55Q3UY51 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms