Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc114Q3UX62 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms