Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVV9

Vwa3a, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3aQ3UVV9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vwa3aQ3UVV9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vwa3aQ3UVV9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vwa3aQ3UVV9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms