Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr1d1Q3UV55 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms