Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29609Q3UU56 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm29609Q3UU56 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29609Q3UU56 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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