Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chpf2Q3UU43 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chpf2Q3UU43 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chpf2Q3UU43 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms