Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
A530084C06RikQ3UTW2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
A530084C06RikQ3UTW2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms