Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms