Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS3

Drc1, Dynein regulatory complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc1Q3USS3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Drc1Q3USS3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Drc1Q3USS3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Drc1Q3USS3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms