Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc190Q3URK1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc190Q3URK1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms